太平天国运动是中国近代史上一次规模宏大且具有深远影响的农民起义，其后期战事的激烈程度和持续时间对中国南方的经济和社会结构产生了深刻的变革。这场历时十年的动荡不仅是一场政治与宗教的革命，也是一场社会经济的剧变，对中国的现代化进程有着不可忽视的影响。

首先，太平天国的战争破坏了传统的农业生产模式。在战争期间，大量的农田被毁坏，耕作工具被掠夺或损坏，农业劳动力也因参军或逃难而大量流失。这些因素导致了农作物减产甚至绝收，严重影响了农村地区的粮食供应和经济稳定。同时，由于战争的频繁发生，许多地方的人口分布发生了显著变化，一些地区出现了人口的大量迁徙，这进一步扰乱了原有的土地利用格局和社会组织形式。

其次，太平天国的统治政策也对经济结构造成了冲击。他们推行了一系列新的土地政策和税收制度，试图通过重新分配土地来缓解贫富差距。然而，这种激进的做法往往导致社会的混乱和不稳定，反而加剧了经济的困境。此外，太平天国还尝试建立自己的货币体系，发行钱币以取代清政府的银两，这在一定程度上促进了商品流通，但也引发了通货膨胀和其他金融问题。

再者，太平天国运动的后期战事深刻地改变了城市的功能和发展方向。许多城市成为了战场，遭受了严重的破坏。例如南京作为太平天国的首都，经历了多次围攻和战斗，城内的基础设施遭到重创，商业活动几乎停滞。其他如苏州、杭州等江南名城也在战火中受损严重，影响了当地的工商业发展。与此同时，一些原本相对较小的城镇因为地理位置的优势或者避开了主要冲突地带，反而得到了一定的发展机遇，从而改变了中国南方的城市布局和经济发展重心。

最后，太平天国运动的社会意识形态也对当时的文化和教育产生了重要影响。太平天国提倡平等和教育普及，虽然他们的实践受到诸多限制，但这一理念在当时引起了广泛的共鸣。他们在占领区兴办学校，传播新思想和新文化，这对打破旧有的封建等级观念和文化垄断起到了积极的作用。然而，随着太平天国的失败，这些改革措施大多未能持久，但其所倡导的教育平等思想却在后来的历史发展中留下了深刻的烙印。

综上所述，太平天国运动后期的战事及其相关政策深刻地影响了中国的南方经济和社会结构。尽管这场运动最终以失败告终，但它所带来的变革却是深远的。它加速了传统农业社会的解体，推动了城市化和工业化的发展，同时也为后来中国现代化的探索提供了宝贵的经验和教训。